Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA5P20719 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA5P20719 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms