Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB4AP20338 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB4AP20338 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms