Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDSP20132 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDSP20132 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SDSP20132 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SDSP20132 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDSP20132 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDSP20132 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SDSP20132 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDSP20132 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SDSP20132 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SDSP20132 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SDSP20132 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SDSP20132 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDSP20132 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDSP20132 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDSP20132 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SDSP20132 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDSP20132 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDSP20132 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDSP20132 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDSP20132 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDSP20132 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDSP20132 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDSP20132 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDSP20132 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SDSP20132 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDSP20132 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDSP20132 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDSP20132 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDSP20132 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDSP20132 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDSP20132 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDSP20132 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDSP20132 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDSP20132 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDSP20132 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SDSP20132 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDSP20132 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDSP20132 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDSP20132 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDSP20132 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SDSP20132 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDSP20132 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDSP20132 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDSP20132 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDSP20132 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDSP20132 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDSP20132 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SDSP20132 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDSP20132 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDSP20132 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SDSP20132 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDSP20132 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDSP20132 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SDSP20132 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SDSP20132 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDSP20132 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDSP20132 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDSP20132 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDSP20132 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDSP20132 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDSP20132 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SDSP20132 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SDSP20132 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDSP20132 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDSP20132 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDSP20132 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDSP20132 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SDSP20132 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDSP20132 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDSP20132 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDSP20132 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDSP20132 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDSP20132 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDSP20132 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SDSP20132 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDSP20132 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDSP20132 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDSP20132 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDSP20132 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDSP20132 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SDSP20132 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDSP20132 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDSP20132 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDSP20132 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDSP20132 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDSP20132 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDSP20132 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDSP20132 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDSP20132 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDSP20132 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SDSP20132 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDSP20132 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDSP20132 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SDSP20132 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDSP20132 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDSP20132 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDSP20132 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDSP20132 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SDSP20132 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms