Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCN1P20061 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCN1P20061 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCN1P20061 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCN1P20061 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCN1P20061 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCN1P20061 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCN1P20061 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCN1P20061 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCN1P20061 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCN1P20061 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCN1P20061 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCN1P20061 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCN1P20061 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCN1P20061 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCN1P20061 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCN1P20061 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCN1P20061 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCN1P20061 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCN1P20061 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCN1P20061 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCN1P20061 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCN1P20061 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCN1P20061 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCN1P20061 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCN1P20061 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCN1P20061 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TCN1P20061 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCN1P20061 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCN1P20061 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCN1P20061 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCN1P20061 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCN1P20061 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCN1P20061 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCN1P20061 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCN1P20061 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCN1P20061 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCN1P20061 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCN1P20061 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCN1P20061 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCN1P20061 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCN1P20061 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCN1P20061 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCN1P20061 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TCN1P20061 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCN1P20061 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCN1P20061 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCN1P20061 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCN1P20061 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCN1P20061 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCN1P20061 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCN1P20061 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCN1P20061 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCN1P20061 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCN1P20061 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCN1P20061 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCN1P20061 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCN1P20061 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCN1P20061 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCN1P20061 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCN1P20061 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCN1P20061 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCN1P20061 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCN1P20061 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCN1P20061 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCN1P20061 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCN1P20061 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms