Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFEBP19484 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFEBP19484 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFEBP19484 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFEBP19484 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFEBP19484 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFEBP19484 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFEBP19484 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFEBP19484 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFEBP19484 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFEBP19484 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFEBP19484 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFEBP19484 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFEBP19484 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFEBP19484 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFEBP19484 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFEBP19484 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFEBP19484 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TFEBP19484 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFEBP19484 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFEBP19484 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFEBP19484 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFEBP19484 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFEBP19484 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFEBP19484 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFEBP19484 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFEBP19484 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFEBP19484 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFEBP19484 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFEBP19484 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFEBP19484 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFEBP19484 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFEBP19484 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFEBP19484 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFEBP19484 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFEBP19484 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFEBP19484 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFEBP19484 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TFEBP19484 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFEBP19484 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFEBP19484 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFEBP19484 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TFEBP19484 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFEBP19484 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFEBP19484 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFEBP19484 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFEBP19484 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFEBP19484 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFEBP19484 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFEBP19484 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFEBP19484 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFEBP19484 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFEBP19484 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFEBP19484 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFEBP19484 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFEBP19484 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFEBP19484 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFEBP19484 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFEBP19484 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFEBP19484 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFEBP19484 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFEBP19484 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFEBP19484 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFEBP19484 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFEBP19484 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFEBP19484 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFEBP19484 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFEBP19484 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFEBP19484 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFEBP19484 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TFEBP19484 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFEBP19484 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TFEBP19484 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFEBP19484 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFEBP19484 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFEBP19484 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFEBP19484 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFEBP19484 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFEBP19484 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFEBP19484 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFEBP19484 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFEBP19484 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms