Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TNNI3P19429 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNNI3P19429 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms