Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR2EP19388 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POLR2EP19388 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR2EP19388 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms