Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLR2CP19387 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR2CP19387 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms