Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF6P18850 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6P18850 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6P18850 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6P18850 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6P18850 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6P18850 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6P18850 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6P18850 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6P18850 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6P18850 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6P18850 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6P18850 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF6P18850 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6P18850 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6P18850 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6P18850 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6P18850 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6P18850 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6P18850 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6P18850 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6P18850 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6P18850 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6P18850 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF6P18850 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATF6P18850 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATF6P18850 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATF6P18850 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF6P18850 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF6P18850 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF6P18850 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF6P18850 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF6P18850 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF6P18850 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF6P18850 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF6P18850 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF6P18850 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF6P18850 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF6P18850 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF6P18850 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF6P18850 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF6P18850 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF6P18850 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF6P18850 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF6P18850 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF6P18850 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF6P18850 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF6P18850 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF6P18850 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF6P18850 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF6P18850 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF6P18850 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF6P18850 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF6P18850 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF6P18850 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF6P18850 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF6P18850 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF6P18850 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF6P18850 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF6P18850 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF6P18850 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF6P18850 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATF6P18850 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF6P18850 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF6P18850 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF6P18850 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF6P18850 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF6P18850 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF6P18850 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF6P18850 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF6P18850 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATF6P18850 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF6P18850 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF6P18850 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATF6P18850 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF6P18850 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF6P18850 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF6P18850 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF6P18850 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF6P18850 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF6P18850 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF6P18850 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF6P18850 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATF6P18850 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATF6P18850 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms