Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL17P18621 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL17P18621 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL17P18621 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL17P18621 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL17P18621 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL17P18621 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RPL17P18621 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
RPL17P18621 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL17P18621 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL17P18621 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL17P18621 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL17P18621 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL17P18621 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL17P18621 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL17P18621 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL17P18621 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL17P18621 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RPL17P18621 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL17P18621 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL17P18621 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL17P18621 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL17P18621 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL17P18621 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL17P18621 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL17P18621 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RPL17P18621 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL17P18621 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL17P18621 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL17P18621 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL17P18621 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL17P18621 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL17P18621 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL17P18621 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL17P18621 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL17P18621 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL17P18621 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL17P18621 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL17P18621 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RPL17P18621 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RPL17P18621 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RPL17P18621 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPL17P18621 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL17P18621 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL17P18621 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPL17P18621 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL17P18621 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL17P18621 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL17P18621 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL17P18621 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL17P18621 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms