Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CKMT2P17540 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CKMT2P17540 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CKMT2P17540 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms