Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB3P16520 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB3P16520 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB3P16520 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB3P16520 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB3P16520 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GNB3P16520 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB3P16520 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB3P16520 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB3P16520 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB3P16520 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB3P16520 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB3P16520 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB3P16520 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB3P16520 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB3P16520 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GNB3P16520 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GNB3P16520 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GNB3P16520 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GNB3P16520 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GNB3P16520 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GNB3P16520 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB3P16520 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB3P16520 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB3P16520 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB3P16520 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB3P16520 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB3P16520 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB3P16520 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GNB3P16520 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms