Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDGFRAP16234 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDGFRAP16234 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms