Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VEGFAP15692 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
VEGFAP15692 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VEGFAP15692 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms