Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UCHL3P15374 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UCHL3P15374 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms