Protein–RNA interactions for Protein: P15328

FOLR1, Folate receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR1P15328 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOLR1P15328 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOLR1P15328 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FOLR1P15328 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOLR1P15328 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOLR1P15328 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FOLR1P15328 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FOLR1P15328 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FOLR1P15328 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOLR1P15328 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOLR1P15328 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOLR1P15328 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOLR1P15328 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FOLR1P15328 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOLR1P15328 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOLR1P15328 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FOLR1P15328 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FOLR1P15328 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOLR1P15328 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms