Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC5A1P13866 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC5A1P13866 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC5A1P13866 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms