Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HLA-DOBP13765 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HLA-DOBP13765 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms