Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HLA-EP13747 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HLA-EP13747 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms