Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RARGP13631 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARGP13631 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARGP13631 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARGP13631 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARGP13631 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARGP13631 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARGP13631 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARGP13631 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RARGP13631 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RARGP13631 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RARGP13631 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARGP13631 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARGP13631 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARGP13631 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARGP13631 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARGP13631 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RARGP13631 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RARGP13631 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARGP13631 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARGP13631 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARGP13631 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARGP13631 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARGP13631 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARGP13631 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RARGP13631 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARGP13631 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARGP13631 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARGP13631 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARGP13631 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARGP13631 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARGP13631 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RARGP13631 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARGP13631 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RARGP13631 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARGP13631 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARGP13631 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARGP13631 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARGP13631 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARGP13631 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARGP13631 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARGP13631 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARGP13631 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARGP13631 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARGP13631 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RARGP13631 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARGP13631 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARGP13631 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARGP13631 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARGP13631 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARGP13631 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARGP13631 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RARGP13631 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARGP13631 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARGP13631 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARGP13631 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARGP13631 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARGP13631 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARGP13631 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARGP13631 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RARGP13631 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARGP13631 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARGP13631 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARGP13631 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARGP13631 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RARGP13631 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARGP13631 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARGP13631 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARGP13631 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARGP13631 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RARGP13631 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARGP13631 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARGP13631 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RARGP13631 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARGP13631 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RARGP13631 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARGP13631 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RARGP13631 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARGP13631 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARGP13631 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARGP13631 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RARGP13631 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms