Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACTN1P12814 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACTN1P12814 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms