Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKBP12277 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKBP12277 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKBP12277 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CKBP12277 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKBP12277 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CKBP12277 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CKBP12277 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKBP12277 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKBP12277 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKBP12277 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKBP12277 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKBP12277 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKBP12277 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKBP12277 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKBP12277 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKBP12277 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CKBP12277 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKBP12277 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKBP12277 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKBP12277 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CKBP12277 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKBP12277 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKBP12277 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKBP12277 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKBP12277 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKBP12277 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKBP12277 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKBP12277 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKBP12277 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CKBP12277 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKBP12277 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKBP12277 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKBP12277 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKBP12277 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKBP12277 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKBP12277 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKBP12277 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CKBP12277 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKBP12277 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKBP12277 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CKBP12277 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKBP12277 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKBP12277 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKBP12277 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKBP12277 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CKBP12277 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKBP12277 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKBP12277 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKBP12277 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKBP12277 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKBP12277 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CKBP12277 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKBP12277 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKBP12277 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKBP12277 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKBP12277 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKBP12277 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKBP12277 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CKBP12277 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKBP12277 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKBP12277 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKBP12277 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKBP12277 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKBP12277 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKBP12277 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKBP12277 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKBP12277 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKBP12277 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKBP12277 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKBP12277 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKBP12277 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKBP12277 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKBP12277 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKBP12277 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKBP12277 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKBP12277 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKBP12277 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CKBP12277 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKBP12277 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CKBP12277 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKBP12277 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKBP12277 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CKBP12277 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKBP12277 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKBP12277 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms