Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRFP11831 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFP11831 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFP11831 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFP11831 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFP11831 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFP11831 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFP11831 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFP11831 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFP11831 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFP11831 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRFP11831 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFP11831 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFP11831 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFP11831 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFP11831 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFP11831 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFP11831 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFP11831 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFP11831 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFP11831 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFP11831 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRFP11831 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFP11831 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFP11831 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFP11831 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFP11831 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFP11831 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFP11831 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFP11831 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFP11831 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFP11831 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFP11831 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFP11831 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFP11831 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFP11831 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFP11831 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFP11831 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFP11831 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFP11831 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFP11831 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFP11831 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFP11831 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFP11831 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFP11831 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFP11831 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFP11831 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFP11831 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRFP11831 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRFP11831 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRFP11831 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRFP11831 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRFP11831 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SRFP11831 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRFP11831 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRFP11831 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRFP11831 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRFP11831 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRFP11831 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRFP11831 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRFP11831 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRFP11831 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRFP11831 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRFP11831 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRFP11831 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRFP11831 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFP11831 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFP11831 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFP11831 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFP11831 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFP11831 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFP11831 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFP11831 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms