Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TMIGD3P0DMS9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMIGD3P0DMS9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms