Protein–RNA interactions for Protein: P0DKB5

TPBGL, Trophoblast glycoprotein-like, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGLP0DKB5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPBGLP0DKB5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPBGLP0DKB5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPBGLP0DKB5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPBGLP0DKB5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TPBGLP0DKB5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TPBGLP0DKB5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TPBGLP0DKB5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TPBGLP0DKB5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms