Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RD3LP0DJH9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms