Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
C4AP0C0L4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C4AP0C0L4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C4AP0C0L4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms