Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT7P08729 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT7P08729 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT7P08729 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT7P08729 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT7P08729 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT7P08729 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT7P08729 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT7P08729 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRT7P08729 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT7P08729 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT7P08729 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT7P08729 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT7P08729 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT7P08729 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT7P08729 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT7P08729 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT7P08729 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT7P08729 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT7P08729 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRT7P08729 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT7P08729 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT7P08729 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT7P08729 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT7P08729 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT7P08729 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT7P08729 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KRT7P08729 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT7P08729 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT7P08729 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT7P08729 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT7P08729 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT7P08729 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT7P08729 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KRT7P08729 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT7P08729 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT7P08729 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT7P08729 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT7P08729 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT7P08729 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT7P08729 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT7P08729 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT7P08729 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KRT7P08729 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT7P08729 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT7P08729 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT7P08729 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT7P08729 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT7P08729 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT7P08729 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT7P08729 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT7P08729 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT7P08729 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT7P08729 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT7P08729 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT7P08729 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT7P08729 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KRT7P08729 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT7P08729 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT7P08729 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT7P08729 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT7P08729 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT7P08729 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT7P08729 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT7P08729 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT7P08729 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT7P08729 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT7P08729 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KRT7P08729 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT7P08729 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT7P08729 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT7P08729 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT7P08729 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT7P08729 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT7P08729 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT7P08729 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT7P08729 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KRT7P08729 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT7P08729 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT7P08729 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT7P08729 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT7P08729 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT7P08729 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT7P08729 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT7P08729 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT7P08729 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT7P08729 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT7P08729 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT7P08729 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KRT7P08729 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KRT7P08729 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms