Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRCP08575 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRCP08575 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRCP08575 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
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