Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HSP90AB1P08238 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HSP90AB1P08238 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms