Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOP08100 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOP08100 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOP08100 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOP08100 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOP08100 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOP08100 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHOP08100 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOP08100 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOP08100 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOP08100 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOP08100 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOP08100 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOP08100 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOP08100 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOP08100 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHOP08100 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOP08100 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOP08100 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOP08100 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOP08100 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOP08100 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOP08100 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOP08100 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOP08100 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOP08100 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOP08100 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOP08100 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOP08100 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOP08100 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHOP08100 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOP08100 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOP08100 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHOP08100 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOP08100 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOP08100 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOP08100 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOP08100 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOP08100 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOP08100 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOP08100 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOP08100 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOP08100 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOP08100 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOP08100 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOP08100 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOP08100 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHOP08100 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOP08100 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOP08100 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOP08100 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOP08100 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOP08100 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOP08100 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOP08100 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOP08100 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOP08100 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOP08100 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHOP08100 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOP08100 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOP08100 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOP08100 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOP08100 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOP08100 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOP08100 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOP08100 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOP08100 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOP08100 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOP08100 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOP08100 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOP08100 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHOP08100 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHOP08100 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOP08100 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOP08100 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOP08100 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOP08100 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOP08100 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOP08100 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOP08100 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOP08100 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOP08100 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOP08100 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOP08100 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOP08100 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms