Protein–RNA interactions for Protein: P05156

CFI, Complement factor I, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFIP05156 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFIP05156 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFIP05156 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFIP05156 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFIP05156 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFIP05156 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFIP05156 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFIP05156 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFIP05156 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFIP05156 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFIP05156 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFIP05156 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFIP05156 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFIP05156 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFIP05156 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFIP05156 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFIP05156 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFIP05156 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFIP05156 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFIP05156 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFIP05156 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFIP05156 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFIP05156 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFIP05156 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFIP05156 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFIP05156 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFIP05156 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFIP05156 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFIP05156 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFIP05156 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CFIP05156 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CFIP05156 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CFIP05156 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CFIP05156 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFIP05156 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFIP05156 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFIP05156 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFIP05156 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFIP05156 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFIP05156 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFIP05156 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CFIP05156 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CFIP05156 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFIP05156 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFIP05156 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFIP05156 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFIP05156 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFIP05156 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFIP05156 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFIP05156 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFIP05156 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFIP05156 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CFIP05156 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFIP05156 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFIP05156 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFIP05156 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFIP05156 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFIP05156 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFIP05156 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFIP05156 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFIP05156 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFIP05156 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFIP05156 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFIP05156 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFIP05156 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFIP05156 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFIP05156 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms