Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPN1P04843 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPN1P04843 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPN1P04843 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPN1P04843 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPN1P04843 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPN1P04843 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPN1P04843 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPN1P04843 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPN1P04843 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPN1P04843 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPN1P04843 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPN1P04843 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPN1P04843 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPN1P04843 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RPN1P04843 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPN1P04843 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPN1P04843 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPN1P04843 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPN1P04843 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPN1P04843 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPN1P04843 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPN1P04843 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPN1P04843 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPN1P04843 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPN1P04843 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPN1P04843 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPN1P04843 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPN1P04843 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPN1P04843 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPN1P04843 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPN1P04843 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPN1P04843 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPN1P04843 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPN1P04843 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPN1P04843 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPN1P04843 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPN1P04843 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPN1P04843 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPN1P04843 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPN1P04843 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPN1P04843 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN1P04843 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN1P04843 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN1P04843 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN1P04843 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN1P04843 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN1P04843 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN1P04843 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN1P04843 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN1P04843 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN1P04843 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RPN1P04843 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPN1P04843 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPN1P04843 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPN1P04843 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPN1P04843 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPN1P04843 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPN1P04843 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN1P04843 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN1P04843 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN1P04843 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN1P04843 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN1P04843 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN1P04843 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN1P04843 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN1P04843 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN1P04843 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN1P04843 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN1P04843 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN1P04843 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN1P04843 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPN1P04843 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN1P04843 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN1P04843 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN1P04843 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN1P04843 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN1P04843 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN1P04843 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN1P04843 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN1P04843 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN1P04843 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms