Protein–RNA interactions for Protein: P02708

CHRNA1, Acetylcholine receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA1P02708 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHRNA1P02708 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA1P02708 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA1P02708 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA1P02708 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms