Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGAP02671 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGAP02671 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGAP02671 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FGAP02671 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGAP02671 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGAP02671 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGAP02671 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGAP02671 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGAP02671 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGAP02671 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGAP02671 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FGAP02671 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGAP02671 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGAP02671 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGAP02671 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGAP02671 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGAP02671 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGAP02671 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGAP02671 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGAP02671 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGAP02671 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FGAP02671 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGAP02671 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FGAP02671 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGAP02671 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGAP02671 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGAP02671 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FGAP02671 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
FGAP02671 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGAP02671 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGAP02671 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGAP02671 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGAP02671 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FGAP02671 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGAP02671 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGAP02671 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGAP02671 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FGAP02671 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FGAP02671 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGAP02671 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FGAP02671 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGAP02671 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGAP02671 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGAP02671 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FGAP02671 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGAP02671 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FGAP02671 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FGAP02671 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGAP02671 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FGAP02671 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FGAP02671 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FGAP02671 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGAP02671 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FGAP02671 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGAP02671 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGAP02671 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGAP02671 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGAP02671 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGAP02671 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FGAP02671 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGAP02671 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGAP02671 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGAP02671 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGAP02671 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGAP02671 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FGAP02671 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGAP02671 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGAP02671 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGAP02671 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGAP02671 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGAP02671 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGAP02671 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGAP02671 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGAP02671 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGAP02671 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGAP02671 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGAP02671 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGAP02671 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGAP02671 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGAP02671 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGAP02671 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGAP02671 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGAP02671 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGAP02671 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGAP02671 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGAP02671 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGAP02671 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGAP02671 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGAP02671 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGAP02671 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGAP02671 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGAP02671 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGAP02671 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGAP02671 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGAP02671 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGAP02671 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGAP02671 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGAP02671 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGAP02671 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms