Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TNNC2P02585 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC2P02585 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms