Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPTA1P02549 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPTA1P02549 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SPTA1P02549 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms