Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHDP01880 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHDP01880 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHDP01880 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHDP01880 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IGHDP01880 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
IGHDP01880 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHDP01880 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHDP01880 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHDP01880 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHDP01880 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHDP01880 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHDP01880 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHDP01880 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHDP01880 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHDP01880 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHDP01880 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHDP01880 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHDP01880 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IGHDP01880 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGHDP01880 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGHDP01880 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IGHDP01880 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IGHDP01880 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IGHDP01880 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGHDP01880 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IGHDP01880 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGHDP01880 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IGHDP01880 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IGHDP01880 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IGHDP01880 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IGHDP01880 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHDP01880 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHDP01880 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHDP01880 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHDP01880 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHDP01880 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHDP01880 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHDP01880 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHDP01880 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHDP01880 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHDP01880 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHDP01880 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IGHDP01880 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHDP01880 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHDP01880 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHDP01880 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHDP01880 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHDP01880 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHDP01880 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHDP01880 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHDP01880 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHDP01880 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHDP01880 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHDP01880 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHDP01880 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHDP01880 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHDP01880 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHDP01880 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHDP01880 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHDP01880 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHDP01880 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IGHDP01880 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IGHDP01880 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IGHDP01880 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHDP01880 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHDP01880 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHDP01880 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHDP01880 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHDP01880 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHDP01880 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHDP01880 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHDP01880 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHDP01880 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHDP01880 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHDP01880 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHDP01880 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHDP01880 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHDP01880 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHDP01880 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHDP01880 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHDP01880 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHDP01880 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHDP01880 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHDP01880 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHDP01880 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms