Protein–RNA interactions for Protein: P01213

PDYN, Proenkephalin-B, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDYNP01213 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDYNP01213 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDYNP01213 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDYNP01213 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDYNP01213 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDYNP01213 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDYNP01213 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDYNP01213 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDYNP01213 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PDYNP01213 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDYNP01213 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDYNP01213 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDYNP01213 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDYNP01213 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDYNP01213 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDYNP01213 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDYNP01213 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDYNP01213 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDYNP01213 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDYNP01213 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDYNP01213 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDYNP01213 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDYNP01213 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDYNP01213 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDYNP01213 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDYNP01213 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDYNP01213 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDYNP01213 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDYNP01213 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDYNP01213 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDYNP01213 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDYNP01213 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDYNP01213 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDYNP01213 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDYNP01213 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDYNP01213 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDYNP01213 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDYNP01213 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDYNP01213 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDYNP01213 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDYNP01213 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDYNP01213 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDYNP01213 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDYNP01213 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDYNP01213 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDYNP01213 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDYNP01213 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDYNP01213 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDYNP01213 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PDYNP01213 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDYNP01213 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDYNP01213 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDYNP01213 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDYNP01213 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDYNP01213 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDYNP01213 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDYNP01213 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDYNP01213 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDYNP01213 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDYNP01213 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDYNP01213 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDYNP01213 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDYNP01213 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDYNP01213 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDYNP01213 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDYNP01213 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDYNP01213 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PDYNP01213 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDYNP01213 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDYNP01213 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDYNP01213 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms