Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHAP00338 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHAP00338 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHAP00338 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHAP00338 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHAP00338 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHAP00338 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHAP00338 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHAP00338 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHAP00338 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHAP00338 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LDHAP00338 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHAP00338 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHAP00338 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHAP00338 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHAP00338 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHAP00338 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHAP00338 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHAP00338 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHAP00338 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LDHAP00338 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHAP00338 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHAP00338 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHAP00338 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHAP00338 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHAP00338 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHAP00338 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHAP00338 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHAP00338 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHAP00338 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHAP00338 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LDHAP00338 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHAP00338 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHAP00338 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHAP00338 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHAP00338 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHAP00338 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHAP00338 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHAP00338 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHAP00338 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHAP00338 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHAP00338 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHAP00338 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHAP00338 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LDHAP00338 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LDHAP00338 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LDHAP00338 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LDHAP00338 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDHAP00338 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDHAP00338 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDHAP00338 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDHAP00338 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDHAP00338 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDHAP00338 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDHAP00338 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDHAP00338 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDHAP00338 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDHAP00338 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LDHAP00338 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDHAP00338 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDHAP00338 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LDHAP00338 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDHAP00338 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDHAP00338 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LDHAP00338 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms