Protein–RNA interactions for Protein: O95977

S1PR4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR4O95977 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
S1PR4O95977 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
S1PR4O95977 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms