Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYF2O95926 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYF2O95926 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYF2O95926 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYF2O95926 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYF2O95926 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYF2O95926 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYF2O95926 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYF2O95926 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYF2O95926 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYF2O95926 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYF2O95926 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYF2O95926 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYF2O95926 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYF2O95926 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYF2O95926 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYF2O95926 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYF2O95926 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYF2O95926 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYF2O95926 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYF2O95926 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYF2O95926 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYF2O95926 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYF2O95926 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYF2O95926 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYF2O95926 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYF2O95926 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYF2O95926 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYF2O95926 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYF2O95926 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYF2O95926 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYF2O95926 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYF2O95926 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYF2O95926 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYF2O95926 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYF2O95926 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYF2O95926 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYF2O95926 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYF2O95926 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYF2O95926 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYF2O95926 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYF2O95926 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYF2O95926 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYF2O95926 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYF2O95926 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYF2O95926 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYF2O95926 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYF2O95926 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYF2O95926 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYF2O95926 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYF2O95926 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYF2O95926 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYF2O95926 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYF2O95926 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYF2O95926 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYF2O95926 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYF2O95926 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYF2O95926 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYF2O95926 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYF2O95926 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYF2O95926 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYF2O95926 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYF2O95926 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYF2O95926 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYF2O95926 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYF2O95926 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYF2O95926 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYF2O95926 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYF2O95926 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYF2O95926 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYF2O95926 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SYF2O95926 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYF2O95926 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYF2O95926 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYF2O95926 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYF2O95926 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYF2O95926 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYF2O95926 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYF2O95926 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYF2O95926 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SYF2O95926 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYF2O95926 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYF2O95926 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYF2O95926 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SYF2O95926 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SYF2O95926 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms