Protein–RNA interactions for Protein: O95782

AP2A1, AP-2 complex subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2A1O95782 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AP2A1O95782 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP2A1O95782 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms