Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA4FO95754 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA4FO95754 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms