Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
POLR1AO95602 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
POLR1AO95602 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms