Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CLDN9O95484 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CLDN9O95484 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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