Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYNGR4O95473 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNGR4O95473 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms