Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLSTN1O94985 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLSTN1O94985 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLSTN1O94985 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms