Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SOGA1O94964 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC38■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SOGA1O94964 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
SOGA1O94964 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms