Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRIG2O94898 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG2O94898 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms